第八十一章 竞争对手
“有机晶体请下载ccdc库,无机晶体下载iscd库,两者都是免费,设定完毕,开始自动演算……”
李骁设定好数模程序,与剑桥结构数据库链接上,看着电脑屏幕上不断闪现一串串的数据——
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a 8.67 ± 0.008 ?
b 9.05 ± 0.006 ?
c 1.469 ± 0.008 ?
α 90°
β 101.9 ± 0.05°
γ 90°
cell volume 107. ± 1. ?
cell temperature 17 ±k
……
距离得到《理性分子设计》已经过去了三周,这三周他每天都在与这头拦路虎死磕,先是研究这个方法的原理,然后开始设计数模算法、编制程序,再在电脑上尝试运行,结果发现破旧的二手电脑根本就跑不起来。
无奈他干脆花了十几万买了一台专业服务器,搭载好平台后,先后链接了美国蛋白质结构数据库、化学品目录数据库、剑桥结构数据库,进行检索演算。
其中,剑桥结构数据库含有875,000个有机及金属有机化合物的x射线和中子射线衍射的分析数据;美国蛋白质结构数据库包含超过51, 000 个蛋白质的三维结构信息。
这两者都是李骁优先用算法进行检索的目标数据库。
可惜数据太过庞大,即便以十几万的专业服务器而言,也需要一定时间的演算才能有结果。
揉了揉眉心,倍感疲劳的他给自己又冲了一杯咖啡,脑袋靠在椅子靠背上,看着电脑屏幕上掠过的一行行数据,思绪不由得飘荡了起来……
目前演算完成度已经达到了91%,与目标酶的结构契合最高的已知酶结构达到了95%,这个结果已经让他比较满意了,虽然不是100%,但以95%契合度的已知酶进行研究,直至找到100%契合的酶结构,也会减小不小的工作量。
当然,如果走了狗屎运的话,就是直接找到100%契合度的酶结构,说明人类已经发现了这种酶,只是不知道它可以应用在炎性肌细胞的dna裂解上。
在这种最理想的状态下,直接把这种酶购买过来,进行实验就可以了!
“呵呵,我在想什么呢?100%吻合的酶结构,怎么可能?”李骁苦笑打消了这个不切实际的想法,心想:“还有9%的数据还未检索完成,如果能在95%的基础上再提升一些就更好了!”
“可惜我的数学和化学等级还是有点低了,要是能再升一级就好了。”他摇了摇头,有些感叹。
越是对基因的微观世界进行深入研究,越是发现数学、物理和化学的作用不可小觑。
数学有助于对现有数据进行分析、建立数学模型、构建算法,指明研究方向,是一种强大的理论工具。数学弱就是盲人骑瞎马,到处乱撞,甚至有可能研究的方向都是错误的。
化学和物理是两只拐杖,提供了强大的实验工具支持,微观基因研究都是分子层面,需要借助很多化学和物理的手段才能进行实验,这两者弱就像没了两只拐杖,就算知道方向在哪里,走起来也是跌跌撞撞的。
计算机编程能力就更不用说了,工欲善其事必先利其器,如果李骁不是计算机系的高材生,怎么可能仅仅用了一周就搭建起服务器平台,调试好了数模程序呢?
这就好像是一把锋利的砍刀,让李骁能披荆斩棘,前进的道路上走得更顺畅……
……
“不是你亲手点燃的,那就不能叫做火焰!不是你亲手摸过的,那就不能叫做宝石!”
就在李骁有些感慨的时候,手机响起,他连忙按下接听键。
唐教授洪亮的嗓音响起,带着些许的焦急:“喂!李骁啊!今天都8月1日了,报名的截止日,你怎么还没上igem官网报名啊?还有你说的赞助商联系上了没?赶紧让人家过来一趟,把合同签了,没有资金项目怎么开展啊?”
李骁一拍脑门,最近忙得焦头烂额,把这两件要紧事给忙忘了,连忙道:“老师您放心,我今天肯定把这两件事办妥。”
“好好,你可千万别忘了,有什么难处跟我说,你作为队长一定要担起责任来!”
“放心吧老师,我一会就弄报名,下午联系好赞助商,我就去学校一趟,最近一直在弄裂解酶的研究,实在是忙昏头了!”李骁不好意思地道,他听出了唐教授语气中的不放心。
唐国轩一听来了兴趣,连忙问道:“裂解酶的研究?难道你已经找到了能剪切炎性肌细胞dna的裂解酶了?”
“还没有,只是用‘理性分子设计’设计了个数模体系,正用程序在商业数据库上抓数据分析呢!”李骁不好意思地道。
唐国轩一听却是倒吸一口气,理性分子设计可是最近才兴起的分析手段,没有强大的数学和计算机能力,根本就玩不转的,就连他也涉猎不多,即便要做也得拜托数学系的教授帮忙。
现在一听李骁贸然进了这么个大坑,唐国轩可有些着急了,连忙问道:“你有没有把握啊?进展到什么程度了?连接的是什么商业数据库?”
“还算顺利,老师。程序已经跑了快有两周了,连接的是三个商业数据库——美国蛋白质结构数据库、化学品目录数据库、剑桥结构数据库。”李骁不紧不慢地道。
唐国轩却是听得两眼有些发直,他还以为李骁链接的是国内的那些偏小的数据库,没想到这小子竟然直接跟国际知名大数据库干上了,而且一下就链接了三台,那运算的复杂程度和运算量……
一想到这里,他焦急地道:“这三个商业数据库都是国际级的,没有专业服务器根本跑不起来程序,你程序是怎么搭载的?”
“放心吧老师,投资商已经给我投了一台十几万的专业服务器,目前运行两周还算稳定,如果不够用,他们还会给我再投一台更好的。”李骁镇定地道。
他现在可是手握00万,真要是逼急眼了,砸个100万买台更好的服务器不在话下,只是眼下还没到那程度。
“那好吧!你小子不声不响竟然搞出那么大动静来,我都不知道说啥了!”唐国轩笑骂道:“下午两点滚过来一趟,让你联系的投资商赶紧把合同签了,顺便你给我把项目进展汇报汇报,还有团队成员也得叫到一起开个会了,下个月就是项目正式启动了!”
“得嘞。”李骁电话里干脆地回答。
挂了电话,唐国轩看了一眼旁边坐着的王教授和张教授。
张教授问道:“怎么样了?李骁的项目进展到什么程度了?”
“这小子心里有数着呢!下午两点他会带着投资商过来签合同,行不行咱们当面问问他不就知道了嘛!”唐国轩喝了口茶水,镇定地回答。
原来三周过去,李骁一直闭门搞研究,团队没有任何动静,计算机系的刘成和宋鑫心里有点犯嘀咕,就找到张教授,想让他试探一下这边的意思,如果项目有什么变化,俩人也好另有打算。
事实上,王教授那边项目已经风风火火地展开了,进展异常顺利,不过团队在计算机方面有点薄弱,便想把刘成和宋鑫两人给挖过去。
两位教授私下里已经碰过,达成了共识,打算来探探唐国轩的虚实,如果证明李骁这个团队没有操作价值,那张教授就会让刘成和宋鑫退出,趁着报名截止之前加入王聪的团队。
唐国轩如何不知道两人的心思,此时虽然表面镇定,心里也有些犯嘀咕:“李骁啊李骁,下午两点你要是不能带着赞助商过来签合同,项目拿不出具体的规划来,那我也保不住你了!”(未完待续)